More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1252 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  63.01 
 
 
229 aa  291  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  63.59 
 
 
220 aa  289  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.15 
 
 
219 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.68 
 
 
219 aa  248  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  54.21 
 
 
220 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  53.33 
 
 
225 aa  229  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.78 
 
 
217 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  43.33 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.72 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.95 
 
 
218 aa  176  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  45 
 
 
224 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.64 
 
 
221 aa  168  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  40.89 
 
 
215 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.03 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
216 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  36.49 
 
 
218 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.91 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.8 
 
 
217 aa  132  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.24 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.15 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.6 
 
 
216 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.29 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.09 
 
 
226 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.07 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 
272 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  36.58 
 
 
257 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 
225 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
225 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.52 
 
 
222 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
272 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 
223 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  32.59 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
231 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
235 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
272 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
223 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  33.83 
 
 
226 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.96 
 
 
216 aa  101  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  34.5 
 
 
228 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
272 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
226 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  33 
 
 
266 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
224 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 
272 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 
229 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
257 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.18 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  34.18 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 
233 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.18 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  35.03 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  32.69 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.67 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.98 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
227 aa  91.3  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  31.38 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.68 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  36.17 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  35.5 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  33 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  34.85 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>