More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2583 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  99.17 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  99.17 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  98.76 
 
 
241 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  95.58 
 
 
241 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  78.02 
 
 
237 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  81.08 
 
 
238 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  77.16 
 
 
237 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  77.16 
 
 
237 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  79.28 
 
 
238 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  78.38 
 
 
238 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  72.27 
 
 
237 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  71.82 
 
 
237 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  77.78 
 
 
238 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  69.77 
 
 
237 aa  314  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  62.04 
 
 
229 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  61.57 
 
 
229 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  61.11 
 
 
228 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  59.91 
 
 
221 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  59.15 
 
 
218 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  53.88 
 
 
221 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 
224 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  54.55 
 
 
215 aa  227  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  54.79 
 
 
221 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  54.46 
 
 
221 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  52.83 
 
 
222 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 
226 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  51.61 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  52.34 
 
 
221 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  50.69 
 
 
225 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 
222 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  50.7 
 
 
221 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  53.27 
 
 
227 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
222 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  53.14 
 
 
223 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  46.89 
 
 
224 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  46.89 
 
 
224 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
222 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  43.66 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  46.63 
 
 
234 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  43.4 
 
 
223 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  43.66 
 
 
227 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 
221 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  44.6 
 
 
223 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
223 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  41.98 
 
 
223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  41.98 
 
 
223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  41.51 
 
 
223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  44.65 
 
 
233 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  39.72 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  46.48 
 
 
250 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  44.34 
 
 
223 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.34 
 
 
223 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
226 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  44.34 
 
 
223 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
223 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  43.54 
 
 
228 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
229 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  42.2 
 
 
230 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  44.02 
 
 
224 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  43.89 
 
 
223 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 
223 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  43.84 
 
 
222 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  41.87 
 
 
218 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  45.93 
 
 
231 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
219 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  44.61 
 
 
229 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  45.89 
 
 
224 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  40.09 
 
 
228 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
236 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  41.75 
 
 
234 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  44.93 
 
 
224 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  44.93 
 
 
224 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  43.08 
 
 
213 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.94 
 
 
236 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  35.65 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  38.57 
 
 
227 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  39.53 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  39.39 
 
 
226 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 
227 aa  128  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 
227 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 
227 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  39.47 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  35.96 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3364  HAD family hydrolase  45.99 
 
 
221 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  40.53 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>