More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0179 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  40.19 
 
 
224 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
215 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.46 
 
 
219 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.58 
 
 
218 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
225 aa  118  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  36.63 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.36 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.5 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.15 
 
 
220 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
227 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.17 
 
 
221 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.47 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  34.02 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
229 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 
235 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 
272 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 
217 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.32 
 
 
222 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  35.38 
 
 
217 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
272 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 
222 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
219 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 
226 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  34.32 
 
 
232 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
227 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 
225 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
266 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
226 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 
226 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  36.17 
 
 
216 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 
252 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 
226 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.49 
 
 
216 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
218 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 
230 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 
224 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.36 
 
 
216 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
216 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
227 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
227 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
238 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.57 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
231 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.19 
 
 
218 aa  98.6  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.2 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  34.69 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.57 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  31.38 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.2 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.37 
 
 
225 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.14 
 
 
226 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
226 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  38.34 
 
 
257 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>