More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.29 
 
 
218 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  45.07 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  45.32 
 
 
217 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.81 
 
 
220 aa  141  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.89 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.24 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  39.45 
 
 
224 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  37.1 
 
 
225 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
216 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.02 
 
 
220 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
229 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 
219 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.88 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.23 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.88 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  34.08 
 
 
217 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 
217 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.99 
 
 
218 aa  105  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
226 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.93 
 
 
222 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 
228 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.08 
 
 
222 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  31.7 
 
 
228 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
209 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 
231 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.59 
 
 
220 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 
226 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
220 aa  101  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
250 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
235 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
214 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
224 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
223 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.67 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
223 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
226 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.57 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.14 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 
234 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.1 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 
257 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 
266 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 
272 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 
209 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
221 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
216 aa  94  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  31.94 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 
461 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  31.11 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  37.09 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.56 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
229 aa  91.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
252 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
235 aa  91.3  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>