More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1222 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  62.1 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.76 
 
 		 219 aa  244  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.25 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  54.21 
 
 		 220 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  51.61 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  45.16 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.86 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.66 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  41.74 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.63 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.28 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  40.55 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.81 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.74 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.56 
 
 		 217 aa  128  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.48 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.11 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.82 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.59 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.55 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.86 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 266 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 272 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  30.65 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>