More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1646 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.4 
 
 
221 aa  184  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.19 
 
 
218 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.66 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.38 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.74 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
225 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.33 
 
 
217 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  38.25 
 
 
217 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.43 
 
 
220 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.57 
 
 
219 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  40.55 
 
 
229 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  34.11 
 
 
224 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  38.03 
 
 
220 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  36.62 
 
 
218 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 
220 aa  142  4e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 
218 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.03 
 
 
216 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 
218 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.49 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
226 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.23 
 
 
216 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  31.92 
 
 
219 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
216 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
218 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.48 
 
 
218 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.16 
 
 
222 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
227 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
222 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
218 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
214 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 
218 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.77 
 
 
222 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
225 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.5 
 
 
219 aa  102  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
226 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
233 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 
227 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
230 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
272 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.09 
 
 
228 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.31 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
221 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.1 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
272 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
226 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
227 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
272 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.78 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  29.03 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.62 
 
 
251 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
254 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
254 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
254 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  26.29 
 
 
228 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
250 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
227 aa  92  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
232 aa  92  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
234 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>