More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2305 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  58.15 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  56.4 
 
 		 224 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  56.4 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  56.4 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  56.19 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  54.13 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  54.13 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  53.67 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  53.55 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  53.21 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  54.46 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  54.17 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  55.56 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  50.22 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  48.56 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 219 aa  148  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  40.64 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 		 221 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  41.87 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  41.38 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  41.38 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  39.61 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  41 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  40.4 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  37.8 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  39.41 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  35.41 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  38.73 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  32.85 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  32.85 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  35.75 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  35.89 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  32.68 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  35.03 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.82 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>