More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0490 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  57.94 
 
 		 221 aa  255  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  57.01 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  56.81 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  55.87 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  55.92 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  51.17 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  51.64 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  51.87 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  50.23 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  50.71 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  51.17 
 
 		 221 aa  221  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  50.68 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  54.03 
 
 		 241 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  48.17 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  50.71 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  49.76 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  46.61 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 237 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  46.01 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  43.66 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 		 238 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  41.78 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  42.48 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  48.53 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  46.38 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  41.71 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  43.87 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  45.41 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  45.41 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  39.44 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  40.81 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.58 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  39.73 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  39.32 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.18 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  37.26 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  39.22 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  40.7 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  38.84 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  38.05 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  38.14 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  34.91 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  35.41 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.24 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3364  HAD family hydrolase  39.22 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>