More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2235 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  100 
 
 
223 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  57.21 
 
 
221 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  55.35 
 
 
221 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  54.67 
 
 
221 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  54.42 
 
 
221 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  56.76 
 
 
228 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  56.6 
 
 
229 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  54.67 
 
 
227 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  55.09 
 
 
221 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  52.09 
 
 
225 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  53.99 
 
 
237 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  55.19 
 
 
229 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  53.52 
 
 
237 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  51.63 
 
 
225 aa  222  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  52.31 
 
 
221 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  54.67 
 
 
222 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  54.46 
 
 
218 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  52.83 
 
 
237 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
222 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  47.91 
 
 
224 aa  211  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  54.21 
 
 
215 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  53.49 
 
 
241 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  53.49 
 
 
241 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  53.49 
 
 
241 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  53.02 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  53.02 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  53.02 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  53.02 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  52.56 
 
 
241 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  53.3 
 
 
237 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  49.5 
 
 
224 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  49.5 
 
 
224 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  48.83 
 
 
222 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  53.3 
 
 
237 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  53.3 
 
 
237 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  53.3 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  50.47 
 
 
238 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  45.45 
 
 
221 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  50.47 
 
 
238 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  47.76 
 
 
229 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  45.33 
 
 
238 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  45.33 
 
 
227 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
223 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 
222 aa  181  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.99 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  43.98 
 
 
223 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 
223 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 
223 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  52.56 
 
 
238 aa  174  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 
226 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 
223 aa  168  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  43.66 
 
 
218 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
223 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 
223 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  45.07 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  38.89 
 
 
228 aa  157  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  39.73 
 
 
236 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  41.28 
 
 
224 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  42.31 
 
 
229 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  41.4 
 
 
224 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  37.55 
 
 
235 aa  148  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  37.9 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  40.7 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  38.07 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  39.17 
 
 
219 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  40.28 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.28 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  40.28 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  40.28 
 
 
223 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  40.83 
 
 
224 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  40.83 
 
 
224 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  43.35 
 
 
231 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
228 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  42.65 
 
 
222 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.39 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  41.1 
 
 
229 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  38.81 
 
 
220 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
225 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  38.67 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  36.57 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3364  HAD family hydrolase  45.62 
 
 
221 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.68 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  37.07 
 
 
227 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 
250 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
229 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
225 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
227 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>