More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0122 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  95.34 
 
 
236 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  68.51 
 
 
235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 
223 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  43.11 
 
 
221 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  43.3 
 
 
223 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.04 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 
223 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
223 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
223 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 
223 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  42.04 
 
 
228 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 
222 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  36.91 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  37.28 
 
 
237 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  39.48 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
237 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  36.44 
 
 
234 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 
224 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 
224 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 
250 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 
218 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  38.84 
 
 
219 aa  141  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  38.6 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  39.65 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 
219 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
222 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
224 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
221 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 
215 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
229 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
241 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  34.98 
 
 
222 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  39.38 
 
 
231 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  39.74 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  32.88 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  39.74 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  39.74 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  34.82 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
225 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
227 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  38.25 
 
 
223 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 
233 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
238 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
238 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
238 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 
230 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 
222 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  31.39 
 
 
239 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  30.8 
 
 
228 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
226 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
230 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  33.78 
 
 
224 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  32.16 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.72 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
224 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 
229 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
224 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 
225 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
220 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 
227 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  34.83 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
209 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.51 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>