More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3364 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3364  HAD family hydrolase  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  39.37 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  44.12 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  44.33 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  44.55 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  40.98 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  42.33 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  39.22 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  40.18 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  42.29 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  46.12 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  37.09 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  41.06 
 
 		 250 aa  128  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  36.63 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  43.22 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  44.92 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  41.4 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  44.92 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  44.92 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  44.92 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  37.13 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  40.11 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  40.3 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  40.3 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  38.17 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  37.63 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  41.08 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35.82 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 272 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  34.67 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 461 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  36.6 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  33.95 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  33.95 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>