More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1642 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  49.74 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  35.18 
 
 
230 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.84 
 
 
231 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  36 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  36 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36 
 
 
236 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  35.18 
 
 
230 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  35.5 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.5 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  35.5 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  35.5 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  35.5 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.5 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  35.96 
 
 
231 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.08 
 
 
236 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.84 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  35.84 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  32.32 
 
 
235 aa  124  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  35.4 
 
 
231 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.96 
 
 
231 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  34.07 
 
 
231 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  35.91 
 
 
231 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  35.91 
 
 
231 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  31.82 
 
 
225 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  32.89 
 
 
231 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.65 
 
 
229 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.27 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  32.3 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.75 
 
 
228 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  33.83 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  32.74 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  32.74 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  32.74 
 
 
238 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  32.7 
 
 
224 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
225 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 
231 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.53 
 
 
234 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  32.68 
 
 
224 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  33.86 
 
 
224 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
231 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  32.21 
 
 
229 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 
229 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 
229 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 
230 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
234 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 
225 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  29.21 
 
 
228 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  31.84 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.16 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.64 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  33.68 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  30.19 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  30.19 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  30.19 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.05 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  30.05 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.73 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  29.78 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  29.53 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  31.22 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  32.98 
 
 
225 aa  95.1  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  31.5 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  30.05 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.05 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  30.26 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  30.65 
 
 
245 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  29.73 
 
 
226 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  28.89 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  30.15 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  30.15 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  31.22 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.47 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.47 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.47 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.47 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.47 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.47 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.23 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  28.39 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.39 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  29 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  28.42 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  28.42 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.59 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>