More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3999 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.09 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.61 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.61 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.26 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  37.09 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  34.8 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  35.04 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.09 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  32.03 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  32.03 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  32.03 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  30.3 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  30.3 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.17 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.17 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  29.74 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.87 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.6 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  29.44 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  31.49 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.31 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  33.05 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30.17 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  30.74 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  33.47 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  31.03 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.17 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  29.87 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  31.58 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.58 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.3 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.3 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.3 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.3 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.3 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  30.9 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.45 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  28.45 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  30.17 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  28.45 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30.4 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.02 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  29.74 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  29.87 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  29.74 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.61 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.17 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.44 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.87 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.87 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.63 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.87 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.52 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.02 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.47 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.12 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  26.61 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.24 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.54 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  26.45 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  28.93 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  28.93 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  26.78 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  27.12 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  36.52 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  27.67 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  22.27 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>