273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0740 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  57.27 
 
 
231 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  57.27 
 
 
231 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.99 
 
 
231 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  39.21 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  39.65 
 
 
231 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.99 
 
 
231 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  38.33 
 
 
231 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  38.77 
 
 
231 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.33 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  39.19 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  39.19 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  34.87 
 
 
242 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.5 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  34.5 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  34.5 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  34.5 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  34.5 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  34.93 
 
 
236 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  34.06 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.06 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.5 
 
 
236 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.4 
 
 
227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  35.4 
 
 
230 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  31.53 
 
 
225 aa  138  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
230 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  33.48 
 
 
224 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  33.04 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  33.48 
 
 
224 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  33.33 
 
 
224 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  33.33 
 
 
224 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  33.33 
 
 
224 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  32.31 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  28.82 
 
 
225 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  28.38 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.38 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  33.19 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  28.38 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.82 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  28.38 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  31.72 
 
 
224 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  34.63 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  31.88 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.19 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  28.38 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  28.38 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  29.26 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  28.38 
 
 
225 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  32.74 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.38 
 
 
228 aa  115  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  30.57 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.72 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  31.28 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  30.84 
 
 
245 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  31.39 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  30.26 
 
 
234 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  32.74 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  29.33 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.39 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  28.89 
 
 
238 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  28.57 
 
 
238 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  29.96 
 
 
225 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.06 
 
 
232 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.49 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.71 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.84 
 
 
235 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.19 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  26.29 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.9 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.8 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.75 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  30.7 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  30.34 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  30.34 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  37.1 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.29 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.21 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  23.23 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.98 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  34.86 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.73 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.21 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  25.59 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  23.35 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.18 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>