More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0412 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  50.68 
 
 
229 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  37.66 
 
 
234 aa  165  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.8 
 
 
229 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.06 
 
 
231 aa  148  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.3 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  34.95 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  32.6 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  31.56 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  31.56 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.13 
 
 
224 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
230 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  32.44 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  31.11 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.11 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  31.11 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  31.11 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  32.33 
 
 
224 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
230 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  32.44 
 
 
225 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
231 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  32.44 
 
 
225 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32.04 
 
 
225 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.68 
 
 
231 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  32.52 
 
 
224 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.18 
 
 
231 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.22 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.22 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.22 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.22 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.22 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  29.96 
 
 
224 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  29.96 
 
 
224 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  29.96 
 
 
224 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.96 
 
 
230 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.19 
 
 
231 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  35.18 
 
 
236 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  31.88 
 
 
236 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  30.4 
 
 
224 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  33.17 
 
 
236 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.67 
 
 
236 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 
231 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.17 
 
 
236 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  30.84 
 
 
224 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  32.66 
 
 
236 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  32.66 
 
 
236 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  32.66 
 
 
236 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30.3 
 
 
238 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.87 
 
 
238 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  30.13 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  29.65 
 
 
229 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.66 
 
 
236 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.3 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.66 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  30.36 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.68 
 
 
231 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  30.4 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  30.7 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.6 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.88 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  32.6 
 
 
225 aa  92  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.53 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  28.97 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.81 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  30.23 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  30.23 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  28.76 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  28.82 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.77 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  30.85 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.36 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  26.83 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  25 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.43 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
259 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.63 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  34.25 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.55 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.2 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.88 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>