More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0264 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  31.31 
 
 
241 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  29.22 
 
 
228 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.8 
 
 
235 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
213 aa  101  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.24 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.9 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.4 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.11 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  28.43 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  29.44 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.92 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  29.48 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.4 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.93 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  33.59 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.67 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  38.83 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  30.34 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.96 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.3 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.67 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.26 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  34.81 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.2 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  34.62 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.17 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.2 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.2 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.74 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  39.51 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.56 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.27 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33.06 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.85 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.52 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  26.4 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.67 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.11 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  29.79 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  30.6 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.31 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  25.6 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.02 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.17 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.71 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  31.43 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.5 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  25.52 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  25.6 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>