More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0431 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  74.4 
 
 		 214 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  62.66 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  64.93 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  64.45 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.13 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 		 236 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 468 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 217 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.56 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  31.75 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 225 aa  92  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.57 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.05 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.84 
 
 		 225 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  27.75 
 
 		 214 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.64 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 222 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 217 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.99 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.11 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.15 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  39.06 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  32.72 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.46 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.15 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  30.84 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.3 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.56 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  26.79 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  32.23 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.11 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.98 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.28 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.32 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  26.79 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.64 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.31 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.66 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.84 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  35.61 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.16 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>