More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1882 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  52.08 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  33.81 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 220 aa  99  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.58 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.58 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.5 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.45 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  33.66 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.63 
 
 		 232 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.1 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.15 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  23.36 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.15 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.46 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.2 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.55 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.11 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  34.51 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0492  hydrolase  24.07 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.67 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.71 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.31 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  19.42 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.66 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  23.83 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  39.06 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  25.33 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.75 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.76 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  30.61 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  24.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.21 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  36.56 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.62 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.86 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.31 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  25.83 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.87 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  28.24 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  23.58 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  25.61 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  22.81 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.84 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.52 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.76 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.09 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.51 
 
 		 456 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  25 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  25.71 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.77 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  25.51 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.68 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.78 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>