121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0642 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2832  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.61 
 
 
219 aa  208  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0986  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.89 
 
 
246 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0145  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.01 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.876295 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.78 
 
 
248 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.36 
 
 
228 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
242 aa  55.1  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.18 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.36 
 
 
267 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.56 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.89 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  44.9 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.19 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  33.73 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  33.73 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  31.63 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.8 
 
 
244 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  23.67 
 
 
246 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  27.51 
 
 
292 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.64 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
255 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
231 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.75 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.26 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  24.61 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.84 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.55 
 
 
230 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.35 
 
 
240 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.76 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  55.32 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  43.94 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
259 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.1 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1645  hydrolase  31.82 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  28.88 
 
 
253 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1578  hydrolase  32.9 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000487041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  22.22 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.86 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.77 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  28.47 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  37.08 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  36.92 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.05 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.56 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.22 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.48 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  21.65 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  26.51 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.71 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  21.13 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  28.5 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  22.41 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  53.19 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.92 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.1 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.03 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3591  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  hitchhiker  0.00156423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  33.33 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.8 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.41 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  33 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  46 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.78 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.78 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.78 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.78 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.78 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  30.34 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  32.5 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  41.38 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>