127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1292 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1182  HAD family hydrolase  91.79 
 
 		 207 aa  340  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142459  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.98 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.08 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17550  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.07 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0434357  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.35 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.21 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.34 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.33 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.56 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  35.56 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  28 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 		 298 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.71 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.08 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.48 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.68 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.42 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  29.13 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  27.08 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  27.08 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  27.6 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  27.08 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  27.6 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  27.6 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  27.08 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.34 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  38.37 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.03 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  30.43 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  36.26 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  22.68 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.5 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.79 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  22.95 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.72 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.37 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.73 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1268  HAD family hydrolase  26.78 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  33.71 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.44 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  28.12 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.08 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.8 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  42.62 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  22.55 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.3 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.51 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  24.15 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  27.19 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.13 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  27.86 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.9 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  23.16 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.16 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  21.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  32.29 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  32.29 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.23 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.05 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.62 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>