154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1015 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1452  hydrolase  63.05 
 
 
203 aa  291  5e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1578  hydrolase  50 
 
 
202 aa  234  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000487041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1645  hydrolase  46.43 
 
 
201 aa  196  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.93 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.18 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  44 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.84 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  23.38 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.81 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  26.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.35 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.56 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  31.97 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  27.64 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  32.48 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.36 
 
 
229 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.1 
 
 
225 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  31.73 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
272 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.14 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 
257 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.74 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  27.12 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  27.12 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  26.49 
 
 
234 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.26 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  20.89 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
225 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  27.17 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  27.22 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
225 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  27.12 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  25.42 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  23.74 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  26.72 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.95 
 
 
258 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.61 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  25.48 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  27.86 
 
 
231 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.41 
 
 
583 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
238 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.47 
 
 
206 aa  44.7  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.19 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  24.54 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  24.11 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.95 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  26.47 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  32.5 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.05 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.32 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.83 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.97 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.96 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  22.94 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.59 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25.83 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.04 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  26.23 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  30 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>