More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0245 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
193 aa  383  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.73 
 
 
215 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.7 
 
 
208 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.57 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
238 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.54 
 
 
212 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  39.58 
 
 
224 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  30.21 
 
 
204 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.39 
 
 
188 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  32.57 
 
 
194 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.39 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.39 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.52 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
269 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4814  HAD family hydrolase  41.86 
 
 
221 aa  97.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  34.39 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
221 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.57 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  32.02 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  37.99 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  38.25 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  34.78 
 
 
188 aa  92  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  36.65 
 
 
236 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  38.86 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.8 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.92 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  33.73 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  30.86 
 
 
223 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  40.56 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  40.56 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.84 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  40 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  32.07 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.94 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
226 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.22 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  32.28 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  37.36 
 
 
230 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.96 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.7 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  36.32 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  41.53 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  41.11 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  41.53 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
728 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  38.89 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  31.22 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  33.88 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  33.7 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  38.62 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  35.5 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  30.43 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.11 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  39.56 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  38.22 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  38.8 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.76 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.6 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.47 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  36.56 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  35.87 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.21 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
225 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  38.13 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.67 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.47 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>