More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1715 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
238 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  40.32 
 
 
188 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.7 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  40.76 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  40.76 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  40.76 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  39.13 
 
 
269 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  38.71 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  38.71 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.96 
 
 
202 aa  131  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.44 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  38.17 
 
 
188 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  39.36 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  38.71 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.71 
 
 
188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  38.71 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  38.71 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  38.71 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  39.25 
 
 
187 aa  128  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  35.53 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  38.71 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  36.76 
 
 
188 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  37.57 
 
 
200 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  39.11 
 
 
194 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.2 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  34.05 
 
 
200 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  35.87 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.26 
 
 
197 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.87 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.59 
 
 
201 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.17 
 
 
232 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.33 
 
 
200 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  32.2 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.14 
 
 
223 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  35.59 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.29 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.61 
 
 
456 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  32.57 
 
 
185 aa  92.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
225 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.09 
 
 
456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
456 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.84 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  36.17 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
217 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.34 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.26 
 
 
234 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.22 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.52 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.1 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  29.67 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  32.57 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.03 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.37 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.78 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.37 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.41 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  30.32 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.96 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  30.17 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.51 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>