More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05389 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  76.63 
 
 
185 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  61.11 
 
 
212 aa  259  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  48.7 
 
 
194 aa  194  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.68 
 
 
197 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  43.41 
 
 
188 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  39.57 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  39.57 
 
 
269 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  39.57 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  39.04 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  39.04 
 
 
188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.8 
 
 
202 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  39.89 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.89 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  38.22 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  39.01 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  37.91 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.53 
 
 
202 aa  125  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  37.57 
 
 
188 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  37.36 
 
 
188 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  37.36 
 
 
188 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  37.57 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  37.91 
 
 
188 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  37.91 
 
 
188 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  37.91 
 
 
188 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  35.75 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 
201 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.41 
 
 
201 aa  104  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
200 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.2 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  35.5 
 
 
965 aa  94.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.15 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.12 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  36.08 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
396 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.32 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.09 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.38 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  32.42 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.25 
 
 
219 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  33.73 
 
 
978 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.64 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  29.19 
 
 
214 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  31.43 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.22 
 
 
986 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  29.89 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
271 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  29.19 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.25 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.65 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.32 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  30.9 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  24.73 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.89 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.5 
 
 
456 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.79 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  26.6 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  29.12 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  28.5 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28 
 
 
456 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  30 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  28.81 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.82 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>