More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0770 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  100 
 
 
200 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  63.78 
 
 
202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  63.78 
 
 
202 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  63.78 
 
 
202 aa  258  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.24 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  62.56 
 
 
200 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  45.41 
 
 
188 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  43.85 
 
 
188 aa  157  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  45.41 
 
 
188 aa  157  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  45.41 
 
 
188 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  47.28 
 
 
188 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  47.28 
 
 
188 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  47.28 
 
 
269 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  46.2 
 
 
188 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  44.86 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  44.86 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.86 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  44.86 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  44.86 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  46.74 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  45.41 
 
 
187 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  46.74 
 
 
188 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  43.92 
 
 
188 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  42.33 
 
 
188 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  42.33 
 
 
188 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  42.33 
 
 
188 aa  147  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  41.8 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  42.25 
 
 
188 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  41.18 
 
 
188 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  40.98 
 
 
194 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.31 
 
 
197 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.9 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  35.79 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.57 
 
 
218 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  35.75 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  35.68 
 
 
204 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 
215 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
238 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.33 
 
 
212 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
208 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.03 
 
 
234 aa  101  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  37.85 
 
 
185 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.32 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  29.89 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35 
 
 
232 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  33.7 
 
 
965 aa  94.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.43 
 
 
986 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.57 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.57 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
271 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  30.5 
 
 
216 aa  92  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 
235 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
236 aa  91.3  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.46 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  28.8 
 
 
221 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.11 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.6 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  29.14 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  28.34 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.51 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.98 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  26.84 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.87 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  29.32 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  29.67 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.73 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.94 
 
 
978 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.35 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  32.95 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.27 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.34 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  27.57 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  26.15 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  27.09 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  27.89 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  28.87 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.69 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.72 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  28.87 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>