More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1436 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  64.11 
 
 
221 aa  279  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  44.88 
 
 
219 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  49.24 
 
 
986 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  45.5 
 
 
215 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  40.85 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  43.75 
 
 
219 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  42.51 
 
 
216 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  41.63 
 
 
218 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  43.48 
 
 
219 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  41.79 
 
 
227 aa  175  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  43.66 
 
 
214 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  44.98 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  40.72 
 
 
221 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  39.9 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  46.07 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  45.55 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  45.55 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  42.25 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  44.28 
 
 
219 aa  161  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  44.92 
 
 
978 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  38.65 
 
 
219 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
208 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  44.68 
 
 
965 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  43.01 
 
 
585 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
220 aa  154  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  37.74 
 
 
220 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  39.59 
 
 
220 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  38.65 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  34.6 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  34.15 
 
 
209 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  41 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  37.75 
 
 
223 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  36.51 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.18 
 
 
223 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.29 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  33.96 
 
 
456 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.08 
 
 
456 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
456 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.35 
 
 
1051 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.7 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.19 
 
 
1055 aa  95.1  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.02 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.86 
 
 
1051 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.85 
 
 
1053 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  30.85 
 
 
214 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.85 
 
 
1053 aa  92  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
242 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
232 aa  91.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.52 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.82 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.03 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.12 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28 
 
 
223 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  30.49 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.08 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.35 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.1 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.18 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  32.14 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.65 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.5 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.14 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  32.14 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.46 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.46 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.46 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.14 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.46 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.84 
 
 
1050 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.64 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.03 
 
 
313 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.64 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.74 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.82 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.35 
 
 
1052 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.85 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.12 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.37 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.85 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.66 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.66 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.66 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.66 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.72 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>