More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1875 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  64.49 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  50.51 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  47.09 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  45.5 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  41.46 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  46.34 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  45.05 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  41.67 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  40.98 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  42.19 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  39.02 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  43.92 
 
 		 978 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  41.59 
 
 		 965 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  43.16 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  43.16 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  41.36 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  39.9 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  42.25 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  37.62 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  38.62 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  40.67 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  39.02 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  39.53 
 
 		 585 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  34.6 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  43.43 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  38.35 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  37.56 
 
 		 986 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  38.66 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  36.98 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  38.95 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  37.5 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  38.24 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.26 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  36.32 
 
 		 456 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.92 
 
 		 456 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.86 
 
 		 456 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.28 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  33.69 
 
 		 396 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.01 
 
 		 1051 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  30.05 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  30.05 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  30.05 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  33.51 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  33.51 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.14 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 248 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.68 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  33.74 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.99 
 
 		 1055 aa  86.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 		 269 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  30.99 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  31.69 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.03 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.02 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  28.57 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  30.85 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.27 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.66 
 
 		 1053 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  30.89 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.27 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  32 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30.27 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30.27 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.91 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.82 
 
 		 1053 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  30.27 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  27.27 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  30.11 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30.27 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.82 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.82 
 
 		 1051 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>