More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2878 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  67.86 
 
 
234 aa  322  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.95 
 
 
233 aa  310  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  67.57 
 
 
233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  66.06 
 
 
232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.81 
 
 
254 aa  290  9e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.39 
 
 
232 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.86 
 
 
225 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.67 
 
 
229 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  35.45 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.57 
 
 
231 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.7 
 
 
456 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  34.7 
 
 
456 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 
220 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.2 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
232 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  34.47 
 
 
456 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  35.93 
 
 
219 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  34.29 
 
 
216 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  31.38 
 
 
214 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.49 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.23 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  30.23 
 
 
230 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.32 
 
 
223 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
222 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  24.55 
 
 
221 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.34 
 
 
214 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
219 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.19 
 
 
219 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  31.25 
 
 
228 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.28 
 
 
219 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  29 
 
 
219 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  32.74 
 
 
220 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
218 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.87 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.66 
 
 
396 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.38 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  25.57 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.64 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  31.41 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.48 
 
 
207 aa  95.5  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  34.4 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
226 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  29.81 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.17 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  29.49 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
232 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  30.89 
 
 
188 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.73 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.8 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.8 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  33.85 
 
 
585 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.8 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.85 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.05 
 
 
201 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.16 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  26.13 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.61 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.09 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  30.23 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  27.36 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  29.63 
 
 
220 aa  89  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.97 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 
201 aa  89  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  26.64 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  31.41 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.02 
 
 
188 aa  88.2  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.56 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.57 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.41 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.27 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  31.09 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  31.08 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30.22 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30.22 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  31.61 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.06 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30.22 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.37 
 
 
210 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  30.39 
 
 
188 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>