More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0217 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  50.23 
 
 
220 aa  218  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  50.7 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  46.79 
 
 
228 aa  204  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  45.21 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  46.26 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  46.08 
 
 
215 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  41.51 
 
 
219 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  47.32 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  45.27 
 
 
219 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 
216 aa  175  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  41.2 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  40.27 
 
 
585 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  40.27 
 
 
221 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  41.04 
 
 
218 aa  167  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  43.52 
 
 
214 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  41.63 
 
 
207 aa  166  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  39.17 
 
 
219 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
219 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  38.89 
 
 
219 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  40.29 
 
 
227 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  38.43 
 
 
219 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  39.25 
 
 
221 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  37.96 
 
 
219 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  39.81 
 
 
965 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 
986 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  38.28 
 
 
233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  39.17 
 
 
219 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  37.98 
 
 
219 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  39.15 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
978 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  37.7 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  41.29 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  38.24 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.86 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.49 
 
 
223 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  34.21 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.61 
 
 
246 aa  95.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.89 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.63 
 
 
456 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
219 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.17 
 
 
456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.22 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
456 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.41 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  27.83 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  27.83 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.23 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.64 
 
 
253 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.92 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
396 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.1 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.53 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.13 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.27 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.6 
 
 
1051 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.51 
 
 
1053 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.55 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.92 
 
 
1055 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  25.57 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.34 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  28.14 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.64 
 
 
1051 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  32.45 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.12 
 
 
1053 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  26.48 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.68 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  25.91 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>