More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2233 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  71.43 
 
 
224 aa  315  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  68.14 
 
 
226 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.09 
 
 
224 aa  309  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  65.18 
 
 
228 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.46 
 
 
227 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.09 
 
 
224 aa  238  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  54.98 
 
 
227 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  46.88 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  34.65 
 
 
241 aa  141  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
242 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 
230 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.83 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  31.48 
 
 
222 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
231 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.45 
 
 
456 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30 
 
 
456 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
456 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.46 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.14 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.56 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.17 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.88 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  32.52 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.09 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.61 
 
 
188 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.61 
 
 
188 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.61 
 
 
188 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.08 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.09 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.09 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.09 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.09 
 
 
188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
216 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
218 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  31.98 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  30.53 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  28.22 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.03 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  32.03 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  29.28 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.46 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  26.17 
 
 
214 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  31.09 
 
 
187 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
231 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
220 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.65 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  32 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.06 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.4 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  28.35 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.43 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  28.35 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  27.32 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  28.35 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.17 
 
 
396 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 
188 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.82 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.44 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  28.14 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  28.42 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  28.95 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.41 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  29.17 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>