More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1839 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  78.67 
 
 		 226 aa  345  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  67.86 
 
 		 224 aa  290  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  65.18 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  67.41 
 
 		 224 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  62.56 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  60.66 
 
 		 227 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.21 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  45.09 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.86 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.04 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  34.39 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.15 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 456 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  30.94 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  33.78 
 
 		 456 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.49 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.49 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.45 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  31.31 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  32.51 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.84 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.47 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  32.67 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.34 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.59 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  32.33 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.31 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.92 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  28.21 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  29.47 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.77 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  28.12 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  28.12 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  28.12 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.12 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  33.85 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  32.52 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.82 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  31.05 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  32.18 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.33 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.03 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.38 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  26.29 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  26.29 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  26.29 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.08 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  28.93 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  28.82 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  33.87 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.82 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.07 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>