More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0139 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  71.15 
 
 		 220 aa  308  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.19 
 
 		 211 aa  291  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.66 
 
 		 217 aa  265  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  53.33 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0184  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  34.18 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.77 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  35.53 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 396 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3640  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  29.06 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.08 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.61 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.48 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.22 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  34.3 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  35.03 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.43 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.33 
 
 		 248 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  31.88 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  31.19 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  33.5 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.69 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  35.11 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.69 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  29.63 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.96 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 456 aa  85.1  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  31.84 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.85 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.61 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  27.41 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.18 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.91 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  33.7 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.9 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  30.16 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.26 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  35.05 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.45 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.79 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  29.53 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  25 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  28.22 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.99 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.89 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.74 
 
 		 456 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  32.45 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.23 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  28.23 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  27.27 
 
 		 456 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>