More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5088 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  60.95 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  56.25 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  52.78 
 
 		 216 aa  244  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  51.4 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  56.25 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  56.06 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  50.24 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  49.51 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  51.63 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  47.09 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  50.97 
 
 		 965 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  45.21 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  45.41 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  47.29 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  44.66 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  44.67 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  43.75 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  44.68 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  47.14 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  47.17 
 
 		 978 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  45.11 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  42.92 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  42.86 
 
 		 585 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  44.12 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  39.73 
 
 		 228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  47.98 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  42.59 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  42.59 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  41.78 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  42.59 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  42.13 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  41.67 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  42.13 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  42.13 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  42.13 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  40.1 
 
 		 986 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  42.2 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  41.24 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.01 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.1 
 
 		 456 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  34.1 
 
 		 456 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.82 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.8 
 
 		 313 aa  118  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.66 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.36 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.52 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.32 
 
 		 1314 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.76 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.86 
 
 		 1053 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.08 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.53 
 
 		 1055 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.63 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.18 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.78 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.44 
 
 		 525 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.22 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.52 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.83 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.14 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.45 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.03 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 396 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.91 
 
 		 1053 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.21 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.62 
 
 		 263 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.62 
 
 		 263 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.26 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.61 
 
 		 1051 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.57 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.28 
 
 		 1052 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.28 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.95 
 
 		 1053 aa  101  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.05 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.85 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.47 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.2 
 
 		 1088 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.22 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  31.4 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>