More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3315 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  46.88 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  45.66 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.88 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.25 
 
 
224 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.88 
 
 
224 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  46.7 
 
 
226 aa  201  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  45.09 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.54 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  32.27 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  32.51 
 
 
241 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.35 
 
 
230 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 
230 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.74 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.75 
 
 
456 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.74 
 
 
456 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.25 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  28.25 
 
 
222 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.36 
 
 
456 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
221 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
217 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
226 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 
218 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
221 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 
215 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.87 
 
 
219 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
254 aa  98.6  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.88 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
396 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  26.87 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  30.41 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.45 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.84 
 
 
233 aa  95.1  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 
223 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.73 
 
 
248 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.07 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  33 
 
 
235 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
230 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  28.31 
 
 
233 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  29.7 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.57 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  32 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  24.27 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  29.21 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 
222 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31 
 
 
218 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  28.71 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  28.71 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.66 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  29.13 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  31.63 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 
187 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  31.61 
 
 
188 aa  85.1  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.99 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.99 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  27.98 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.31 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.79 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  25.81 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.99 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  26.87 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  24.17 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.09 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.77 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.09 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  28.45 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.45 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  29.49 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.94 
 
 
217 aa  82  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.94 
 
 
217 aa  82  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.66 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  30.84 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29.9 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>