More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0320 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  48.34 
 
 
218 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  47.39 
 
 
221 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  47.39 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.57 
 
 
217 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  44.19 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  41.04 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.27 
 
 
221 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  44.02 
 
 
230 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  34.86 
 
 
220 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  44.55 
 
 
221 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  37.38 
 
 
228 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  41.2 
 
 
218 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.04 
 
 
213 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  35.96 
 
 
228 aa  148  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  44.08 
 
 
221 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.05 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  45.33 
 
 
231 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  42.78 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 
218 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.07 
 
 
220 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  51.18 
 
 
142 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.52 
 
 
219 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  40.54 
 
 
247 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 
225 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.37 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.98 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.41 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.88 
 
 
456 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33 
 
 
456 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  37.58 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.76 
 
 
218 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.94 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
456 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.07 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
238 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.35 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  36.57 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  32.26 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.82 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.95 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.39 
 
 
248 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.04 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 
213 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  32.61 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
217 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  33.71 
 
 
168 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.96 
 
 
232 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
232 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.37 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.65 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.14 
 
 
219 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.95 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  30.33 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  32.5 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3805  putative phosphatase  32.57 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0764566  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.64 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.04 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  35 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  30.98 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.13 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  35.03 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  33.5 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.47 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.55 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.24 
 
 
216 aa  82  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  30.23 
 
 
225 aa  82  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.35 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.8 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  29.23 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>