More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_338 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  95.18 
 
 		 456 aa  888    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  89.04 
 
 		 456 aa  839    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  926    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.05 
 
 		 225 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 221 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.21 
 
 		 231 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.76 
 
 		 215 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  42.03 
 
 		 226 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  36.23 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.6 
 
 		 223 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4358  peptidase M22, glycoprotease  38.64 
 
 		 216 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.67 
 
 		 220 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 218 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  38.54 
 
 		 219 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0714  peptidase M22 glycoprotease  38.01 
 
 		 216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 221 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.7 
 
 		 233 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 		 217 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 227 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  35.07 
 
 		 214 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 		 219 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 224 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 220 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1634  peptidase M22 glycoprotease  40.62 
 
 		 225 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 396 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 226 aa  123  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  34.1 
 
 		 219 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  35.38 
 
 		 216 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 219 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 225 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.18 
 
 		 234 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 232 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 242 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  35.96 
 
 		 207 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4976  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 		 223 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.53 
 
 		 214 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  35.41 
 
 		 230 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  37.77 
 
 		 209 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.49 
 
 		 218 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  35.32 
 
 		 213 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  31.46 
 
 		 216 aa  113  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  35.27 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  31.36 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.16 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0045  peptidase M22 glycoprotease  33.78 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 225 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 221 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.37 
 
 		 227 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.26 
 
 		 260 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.29 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.36 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  30.56 
 
 		 228 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.5 
 
 		 218 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  31.08 
 
 		 236 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.16 
 
 		 262 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 		 238 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  33.77 
 
 		 228 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  32.58 
 
 		 238 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.22 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.15 
 
 		 229 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 222 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.7 
 
 		 227 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 228 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  30.84 
 
 		 227 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 220 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  32.08 
 
 		 233 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  30.91 
 
 		 235 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 		 234 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.63 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  33.7 
 
 		 195 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  34.72 
 
 		 223 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  31.22 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  33.02 
 
 		 214 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.05 
 
 		 225 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  32.81 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 		 232 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 237 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 		 227 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  27.92 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 217 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  31.28 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.84 
 
 		 216 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.02 
 
 		 227 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.69 
 
 		 228 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 		 228 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.11 
 
 		 233 aa  100  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.01 
 
 		 202 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 225 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.03 
 
 		 218 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 231 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.66 
 
 		 222 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.36 
 
 		 214 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  34.8 
 
 		 220 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 232 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 224 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  36.32 
 
 		 215 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.82 
 
 		 223 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 224 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.08 
 
 		 1055 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>