More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1761 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  50.72 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  51.17 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.02 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  50.93 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.3 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  46.76 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  46.92 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  46.01 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  40.28 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  40.85 
 
 		 228 aa  168  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.55 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  44.02 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.11 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.46 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  42.18 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  50.75 
 
 		 142 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  45.95 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  39.17 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.49 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.18 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.73 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.49 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.96 
 
 		 456 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.4 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  27.73 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.26 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  27.6 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  32.73 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.98 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  26.15 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  26.02 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1198  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.11 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.29 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  27.66 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.95 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  29.58 
 
 		 297 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.7 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  29.72 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.72 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.63 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  29.33 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.78 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.19 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  27.42 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.27 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  32.57 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.09 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2232  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  23.42 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.92 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  25.24 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  28.57 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.39 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.6 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  24.34 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>