More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0649 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1198  haloacid dehalogenase-like hydrolase  90 
 
 		 220 aa  400  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  34.39 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  35.87 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.08 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.6 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.35 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.16 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  33.51 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  28.42 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  26.53 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.98 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  32.62 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  30.16 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  33.92 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  31.31 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.65 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  33.52 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.77 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  31.82 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.55 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.55 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  28.81 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  32.95 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.62 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 		 735 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  32 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 714 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.36 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 710 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.72 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.02 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  28.25 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  39.18 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.23 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.98 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.5 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  30.05 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  37.11 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  32.66 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  29.95 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.8 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.22 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.14 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.38 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.36 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  28.35 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.22 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  28.73 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  25.12 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  30 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  30 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.58 
 
 		 456 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.14 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  28.33 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>