More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3475 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  48.6 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  46.95 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  46.3 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.86 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  45.27 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  43.06 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  41.94 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.55 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  35.55 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.85 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  36.62 
 
 		 228 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.09 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  40.95 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  41.86 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  39.42 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  43.28 
 
 		 142 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.54 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  31.71 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.72 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.28 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  36.31 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  26.64 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2673  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.88 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.27 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.59 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  33.89 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.05 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  30.61 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.33 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.68 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  26.58 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.94 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  29.55 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  30.37 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.35 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  28.98 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.52 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.62 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.42 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  30.54 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.97 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.44 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.86 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  31.84 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.65 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  26.89 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.94 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.28 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  28.12 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  30.05 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2232  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.23 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>