More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7216 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
223 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  43.87 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  43.06 
 
 
221 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  40.47 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  44.22 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  41.51 
 
 
227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  40 
 
 
221 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  42.33 
 
 
241 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  47.57 
 
 
219 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.39 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  39.8 
 
 
230 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.55 
 
 
217 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.57 
 
 
216 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  40.57 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  32.69 
 
 
228 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  41.59 
 
 
247 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.68 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  35.11 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  43.85 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
221 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 
220 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  39.23 
 
 
248 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.87 
 
 
232 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  39.02 
 
 
232 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 
231 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.26 
 
 
456 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.45 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
396 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.02 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.89 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.59 
 
 
234 aa  92.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.72 
 
 
456 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
456 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.43 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  35.21 
 
 
241 aa  89  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.41 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  30.98 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  31.02 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  30.98 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  30.98 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.11 
 
 
188 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.48 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.67 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.68 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  36.04 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  34.9 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2232  HAD family hydrolase  38.46 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  32.82 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.45 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.55 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  34.41 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.74 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.72 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.72 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  30.64 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  30.53 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  34.63 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.72 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  28.88 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.45 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.72 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.73 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  32.26 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.73 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  34 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  35.26 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>