More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2785 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  65.53 
 
 		 267 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.6 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  52.21 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  47.01 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  47.35 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  52.4 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  52.31 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.54 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  47.04 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  50.45 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  49.08 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  47.44 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  45.71 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.12 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.12 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  47.75 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  47.75 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.33 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.11 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.56 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  47.46 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.38 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  45.38 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  48.2 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.96 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.66 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.66 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  45.26 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  47.41 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.02 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  49.56 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.43 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  48.4 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  44.81 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.72 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  45.78 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  40.44 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  47.27 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.09 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  41.6 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  43.95 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.3 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.05 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  39.29 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.15 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  36.12 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  33.6 
 
 		 248 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  32.79 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  36.56 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  29.84 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  31.56 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  32.67 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  35.47 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  32.61 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  33.76 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.81 
 
 		 225 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  32.73 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  32.73 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.74 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  32.27 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  32.27 
 
 		 220 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.27 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  35.71 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.48 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 215 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.02 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1057  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  29.74 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1084  hydrolase  29.74 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.82 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.02 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.02 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  34.17 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  34.02 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.73 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.02 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.96 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.51 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.96 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  34.54 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  27.73 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.48 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  32.83 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>