More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0609 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  49.4 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.97 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.58 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.78 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.54 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.54 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  42.52 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  40.41 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  40.16 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.3 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.3 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.23 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  44.67 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.37 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.9 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  46.79 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.26 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  48.53 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  46.09 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  43.95 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  44.04 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  45.08 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  44.18 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  42.17 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  41.07 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  42.86 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  44.5 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  44.05 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.44 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  45.63 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.5 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  38.96 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  43.72 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  44.16 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.69 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.53 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  42.67 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  43.03 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  41.9 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  35.06 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.5 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  39.52 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  41.23 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  30.36 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  35.63 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  35.6 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  35.11 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  27.87 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  27.16 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  27.89 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  34.42 
 
 		 297 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  26.86 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.82 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.32 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.29 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1057  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  30.15 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1084  hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.73 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.12 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.64 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.69 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.37 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.14 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  31.98 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.13 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.17 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.21 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.24 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  30.81 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  33.65 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>