More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1182 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.78 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  54.7 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  53.88 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.47 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.25 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  53.88 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  48.29 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.38 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  55.13 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  53.85 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.85 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  51.79 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  48.73 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  56.41 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.44 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  53.7 
 
 		 247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  54.5 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  49.01 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  50.68 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  50 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  49.53 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.64 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.63 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  47.66 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.76 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  44.76 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  45.16 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.54 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  41.13 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.35 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  45.53 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  44.95 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.42 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  43.58 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.24 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.61 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  40.74 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  38.33 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  47.96 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  42.23 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  43.88 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.67 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  33.87 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  36.64 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  40.17 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  32.31 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  32.03 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  32.03 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  31.44 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  31 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  35.86 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  29.57 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  36.52 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  34.22 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1057  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.1 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1084  hydrolase  31.69 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  32.1 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.63 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.05 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.61 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.09 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.75 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  30.65 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  30.73 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.63 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.34 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.82 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.42 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.46 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  30.42 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.85 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.38 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.79 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.46 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.64 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.11 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 978 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>