More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1242 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.9 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  55.6 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.6 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.06 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.06 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  55.82 
 
 		 255 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  57.49 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56 
 
 		 252 aa  292  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.26 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.27 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  53.17 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  54.7 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  57.08 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  46.94 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.73 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.73 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  48.77 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  47.54 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  47.35 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.67 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  48.15 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  46.82 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  50 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  46.61 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  46.15 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  45.13 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.11 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  40.44 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.63 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  44.61 
 
 		 272 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.85 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.41 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  41.96 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.16 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  40.57 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  44.64 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.09 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  39.92 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  40.18 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  43.24 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.41 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  41.27 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  34.44 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  34.13 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  35.74 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  31.87 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  32.79 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  31.87 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  34.92 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  35.32 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  33.48 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.05 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.28 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  29.54 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.84 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.96 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  28.79 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  29.6 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.6 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.96 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.01 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.28 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  35.2 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.65 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  27.92 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  28.23 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.35 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1907  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.77 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.89 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  29.58 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.15 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.05 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.06 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  24 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.13 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  24.15 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>