More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2894 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  59.35 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  54.38 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  55.2 
 
 		 248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  56.54 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.16 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  50.23 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  55.25 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  52.19 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  51.82 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.94 
 
 		 267 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.97 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  53.27 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  51.14 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.33 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  48.17 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  50.92 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  50.92 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  48.15 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.49 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.07 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.07 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.54 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.45 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  48.61 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50.46 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.3 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  50.44 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.31 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.53 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.53 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 272 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  48.66 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.66 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  51.85 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  46.4 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  47 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  48.67 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  50.46 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  48.21 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  40.27 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.85 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.26 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.82 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  39.19 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.04 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  34.01 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  33.5 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  40.2 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.2 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  34.55 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  31.34 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  31.16 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  29.65 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  30.65 
 
 		 254 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  32.77 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.76 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.93 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  36.67 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  31.46 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.32 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.27 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.91 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  33.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  33.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  33.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  33.61 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.26 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  32.16 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.79 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.83 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.14 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  27.93 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  35.71 
 
 		 762 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  31.19 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  30.32 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.77 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>