More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4341 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  85.48 
 
 		 248 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  81.05 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  58.05 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  55.1 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  53.62 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  57.87 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  57.87 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  58.8 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.21 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  50.21 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.79 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.79 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.54 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  47.54 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.97 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.45 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  56.54 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.26 
 
 		 258 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  53.92 
 
 		 236 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.05 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.05 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  49.19 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.61 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  52.05 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.23 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  52.21 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  47.54 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  57.21 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  53.12 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.47 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  51.68 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  50.62 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  53.39 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.49 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  50.69 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  50.85 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  53.42 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  45 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  40.79 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.95 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  44.86 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.88 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  40.09 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.02 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.7 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  34.72 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  35.32 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  33.16 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  32.43 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  31.95 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  30.49 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  34.89 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.32 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  32.99 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  37.63 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  33.2 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1084  hydrolase  33.04 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1057  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.48 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  33.48 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  29.15 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.84 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.68 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.05 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.68 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  32.67 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  33.82 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.47 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.52 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.47 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.5 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.89 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1359  hydrolase  32.55 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0172226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.74 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.31 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  31.52 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.46 
 
 		 218 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.14 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 728 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.18 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>