More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2938 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  88.89 
 
 		 230 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  57.87 
 
 		 248 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  57.41 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.56 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  53.77 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.9 
 
 		 267 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  50.92 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.32 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  47.75 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.66 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.53 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  47.32 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  46.19 
 
 		 259 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  47.3 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  45.25 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  47.71 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.15 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  45.7 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.62 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  41.96 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  47.14 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.14 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.15 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.34 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.38 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.38 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.22 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  44.55 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.58 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.58 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  47.09 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  47.03 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  45.09 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  42.27 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  39.57 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  39.46 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.37 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.41 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  41.36 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  30.08 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  40.2 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.64 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  31.42 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  30.53 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  31.31 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  29.41 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  33.33 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  32.9 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.77 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  30.15 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 396 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  32.09 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  32.09 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.67 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.13 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.31 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.76 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.75 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5013  hydrolase  32.13 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376254  normal  0.29251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  32.11 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.84 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 728 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.93 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  28.38 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.26 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  30.88 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>