More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0471 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
210 aa  441  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  41.95 
 
 
221 aa  154  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  40.29 
 
 
226 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.68 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
396 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  34.78 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
219 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  35.92 
 
 
220 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  32.94 
 
 
195 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  33.82 
 
 
214 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.95 
 
 
456 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.56 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0340  HAD superfamily hydrolase  29.76 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.369886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.47 
 
 
456 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  27.57 
 
 
242 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.03 
 
 
228 aa  91.3  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  31.13 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  31.13 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  33.99 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  27.72 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  30.54 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.19 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.73 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  29.47 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.68 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  30.65 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.05 
 
 
217 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  28.71 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.9 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.89 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.96 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.37 
 
 
233 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.11 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  28.44 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.13 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.54 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
235 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.38 
 
 
223 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.62 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.37 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.37 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.14 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.35 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.14 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.69 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.5 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.13 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.47 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.37 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.61 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  25.73 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.57 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.31 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  27.84 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  27.84 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  27.84 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  27.84 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.53 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.17 
 
 
219 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.84 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  24.77 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.92 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.29 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.98 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.65 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  28.34 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.01 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  30.17 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.02 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>