More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3772 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  65.26 
 
 
222 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.11 
 
 
221 aa  284  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  65.35 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  63.38 
 
 
221 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  62.73 
 
 
225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.65 
 
 
221 aa  274  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.53 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60 
 
 
219 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.02 
 
 
217 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.14 
 
 
218 aa  261  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  57.67 
 
 
218 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.07 
 
 
219 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  57.21 
 
 
218 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.54 
 
 
217 aa  258  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.05 
 
 
217 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.51 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  42.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.03 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  42.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.41 
 
 
222 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.93 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.93 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.93 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.93 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.2 
 
 
221 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.2 
 
 
221 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.23 
 
 
221 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  41.15 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.65 
 
 
224 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  41.08 
 
 
221 aa  148  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  39.11 
 
 
220 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.39 
 
 
226 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  39.02 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.7 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  35.14 
 
 
221 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  35.14 
 
 
221 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
221 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  34.59 
 
 
221 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  34.05 
 
 
220 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.59 
 
 
220 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.51 
 
 
235 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 
218 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.3 
 
 
226 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.97 
 
 
235 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
396 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.31 
 
 
213 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
227 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
218 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
215 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
238 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.77 
 
 
248 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 
228 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
223 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.57 
 
 
218 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
222 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  33.84 
 
 
707 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.98 
 
 
188 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  32.84 
 
 
707 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.98 
 
 
188 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.98 
 
 
188 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  34.03 
 
 
456 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.98 
 
 
188 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.98 
 
 
188 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.16 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  32.18 
 
 
714 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.16 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.61 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.29 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.29 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.29 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.98 
 
 
456 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.02 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
286 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 
247 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.98 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  30.68 
 
 
241 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
269 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  32.29 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.52 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>