More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2052 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 707 aa  1452    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  85 
 
 		 710 aa  1201    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  54.2 
 
 		 728 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  98.59 
 
 		 707 aa  1432    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  89.43 
 
 		 714 aa  1263    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.45 
 
 		 217 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  39.34 
 
 		 227 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.2 
 
 		 219 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  37.38 
 
 		 219 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  37.21 
 
 		 216 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 256 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 222 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.5 
 
 		 220 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 		 227 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  32.87 
 
 		 229 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.18 
 
 		 235 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.19 
 
 		 224 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 221 aa  107  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  35.4 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 		 231 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 223 aa  104  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 235 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  32.71 
 
 		 225 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 224 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.84 
 
 		 218 aa  101  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.47 
 
 		 221 aa  99  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 223 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 225 aa  98.2  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 226 aa  97.8  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 221 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  31.44 
 
 		 218 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.24 
 
 		 232 aa  96.3  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.32 
 
 		 221 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 243 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 		 221 aa  94.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.05 
 
 		 225 aa  94  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  30.05 
 
 		 217 aa  94  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 229 aa  92.8  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 213 aa  91.3  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 		 220 aa  91.3  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.96 
 
 		 222 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 227 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 		 223 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  30.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 224 aa  89.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 		 218 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.26 
 
 		 223 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.86 
 
 		 223 aa  89  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.68 
 
 		 217 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 		 228 aa  89  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.35 
 
 		 230 aa  88.6  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 		 225 aa  88.2  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 		 229 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  34.29 
 
 		 222 aa  87.4  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  31.2 
 
 		 229 aa  87.4  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.84 
 
 		 221 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.84 
 
 		 221 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 		 224 aa  87  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 		 188 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 		 188 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  34.08 
 
 		 188 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 		 233 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  30.62 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  32.66 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.02 
 
 		 221 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  31.41 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.38 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.66 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.7 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.73 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 		 247 aa  83.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2232  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 233 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 216 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.78 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2349  HAD family hydrolase  35.67 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.51 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.32 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.22 
 
 		 223 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 		 233 aa  80.5  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>